يسهم برنامج وقاية النبات فى تحقيق رسالة الكلية فى إعداد خريج متميز قادر على المنافسة فى سوق العمل الزراعى المحلى عن طريق التطوير المستمر للبرامج التعليمية والبنية الأساسية للقسم .
ويقوم القسم بوضع برامج بحثية موجهة ومبتكرة فى مجالات وقاية النبات يتم توظيف الطاقات البحثية بها من باحثين وطلاب دراسات عليا بالقسم .
تهدف هذه البرامج إلى تطوير قطاع الزراعة الإنتاجى والبحثى وحل المشكلات المتعلقة به .
كما يقوم القسم بتلبية الحاجات الملحة والمستجدة لسوق العمل من خلال تقديم الخدمات الإستشارية العلمية والدورات التدريبية فى مجال وقاية النبات ( الحشرات الاقتصادية – مبيدات الآفات) وذلك للهيئات والأفراد بالتعاون مع الجهات البحثية المختلفة على المستوى الإقليمى .
هذا بالإضافة إلى مشاركة القسم فى مشاريع قومية تخدم خطة التنمية الزراعية بالوطن .