اتخذ قرار مجلس الجامعة بإنشاء مستشفى الأطفال الجامعي في يوليه ١٩٩٢.
اتخذت إدارة جامعة أسيوط الإجراءات اللازمة نحو تخصيص الأراضي وتوفير الاعتمادات اللازمة لإنشاء المستشفى.
إنشاء مستشفى الجامعة للأطفال على مساحة 7000 متر مربع، وتقع في الجانب الآخر من المستشفى الجامعي الرئيسي من الشمال الغربي، وتتكون من طابق سفلي وخمسة طوابق عليا متكررة، مع سعة كلية تتجاوز 700 سرير بما في ذلك جميع التخصصات الطبية في مجال طب الأطفال والجراحة، وهي أول مستشفى متخصصة لطب الأطفال في صعيد مصر.
