يدير المعهد مجلس المعهد والذي يتم تشكيله طبقاً للنظام المتبع فى اختيار القيادات الجامعية الذي يسري عليه أحكام وشروط قانون تنظيم الجامعات المصرية.رقم 49 لسنة 1972.بشأن تنظيم الجامعات والقرارات المعدلة له.
يقوم المجلس بوضع السياسة العامة للمعهد والخطة العامة للدراسات العليا والبحوث وإقرار المحتوى العلمى للمقررات الدراسية. وكذلك وضع اللوائح وتنظيم ومتابعة الميزانية وتوزيع الاعتمادات وتنظيم وقيد وتسجيل الطلاب واقتراح منح الدرجات العلمية الدراسية والدورات التدريبية واقتراح ندب اعضاء هيئة التدريس الى المعهد ودراسة الموضوعات التى يحيلها عليه مجلس الجامعة. وجميع الاختصاصات والتكليفات والمهام الواردة بقانون تنظيم الجامعات المصرية
يشكل مجلس المعهد طبقاً للمادة (40) من قانون تنظيم الجامعات
برئاسةأ.د/ عميد معهد بحوث ودراسات البيولوجيا الجزيئية.وعضوية كلا من:
ثلاثة اعضاء من خارج المعهد في تخصصات ذات صلة بالمعهد. (يعينون لمدة سنتين بقرار من رئيس الجامعة بناء على اقتراح مجلس المعهد وموافقة مجلس الجامعة) (ولا يجوز لهم الجمع بين عضوية أكثر من مجلس معهد أو كلية داخل جامعة أسيوط كما لا يجوز الجمع بين عضوية مجلس المعهد وعضوية مجلس جامعة أسيوط)
أعضاء مجلس المعهد
التشكيل | الصفــــــــة |
السيد الأستاذ الدكتور/عمرو محمد عبد الفتاح | عميد المعهد ورئيساً |
السيد الأستاذ الدكتور/علاء الدين حامد سيد | وكيل المعهد لشئون الدراسات العليا والبحوث |
السيدة الأستاذ الدكتور/هبه عطية يسي | وكيل المعهد لشئون خدمة المجتمع وتنمية البيئة |
السيدة الأستاذ الدكتور/أسماء محمد زهران عمر | مدير وحدة بحوث البيولوجيا الجزيئية |
السيد الأستاذ الدكتور/ميخائيل نظمي عجبان | رئيس قسم البيولوجيا الجزيئية |
السيدة الأستاذ الدكتور/تغريد عبد العزيز محمد إسماعيل | رئيس قسم الإحصاء الحيوى والمعلوماتية الحيوية التطبيقية |
الدكتور/ هشام يوسف عوض درويش | رئيس قسم البيوتكنولوجيا التطبيقية |
السيد الأستاذ الدكتور/رأفت عبد المنعم حسنين يوسف | رئيس لجنة اخلاقيات البحث العلمى |
السيدة الدكتورة / مروة طلعت كامل المهدي | المشرف علي وحدة الهندسة الوراثية وزراعة الانسجة النباتية |
| السيدة الاستاذ الدكتور / اسماء عبد الناصر احمد حسين | عضو من الخارج |