أهداف القسم:

 * إعداد أطباء بيطريين لهم الدراية الواسعة والشاملة فى مجال الرقابة الصحية على الأغذية سواء من ناحية مقدرتهم على الكشف والتعرف على الأغذية الغير مطابقة للمواصفات وكذلك فحص الأغذية ذات الأصل الحيوانى وتقرير صلاحيتها للإستهلاك الآدمى وأن يكون القسم مركزا مرجعيا فى هذا الأمر 

* تأهيل طلاب الدراسات العليا فى مجال صحة الأغذية والقادرين على عزل وتشخيص مسببات التسمم الغذائى 

 * إجراء بحوث معملية وكذلك بيئية فى مجال صحة الأغذية للتعرف على مدى سلامة الأغذية ذات الأصل الحيوانى وخلوها من مسببات  المرض

* إقامة ندوات ودورات تدريبية وبحثية للأطباء البيطريين العاملين فى مجال صحة الأغذية