رسالة قسم الفاكهة كجزء من رسالة كلية الزراعة وجامعة أسيوط تعمل على تقديم جودة تعليمية وتدريسية متميزة وذلك لإعداد خريجين ذوي مهارات متميزة جاهزين للعمل في المراكز البحثية أو الجامعة أو مؤهلين لمتطلبات سوق العمل .بما يعمل على تطوير قطاع زراعة وانتاج الفاكهة إنتاجياً وبحثياً وحل المشاكل المتعلقة بزراعة وإنتاج الفاكهة خاصة والإنتاج الزراعي على وجه العموم بما يسمح بتنمية هذا القطاع الهام .