يقدم قسم البيولوجيا الجزيئية خدمة تعليمية وبحثية ومجتمعية متميزة في مجال البيولوجيا الجزيئية على المستوى المحلى والإقليمي من خلال برامج دراسية وبحثية متطورة تعمل على إعداد الخريجين للمنافسة في سوق العمل والبحث العلمي على المستوى المحلى والدولي وتوظيف المعارف والتقنيات الحديثة لحل مشاكل التنمية والمجتمع، وذلك في ضوء رسالة معهد بحوث ودراسات البيولوجيا الجزيئية ويضم القسم التخصصات الفرعية التالية:

• الميكربيولوجيا الجزيئية
• المناعة الجزيئية
• الباثولوجيا الجزيئية
• التشخيص الجزيئي لأمراض الكائنات الحية
• الإخصاب المعملي الجزيئي.